Even (2P-002~2P-048)

[2P-046] Biochemical analysis of the light-up RNA aptamer 17-3 to elucidate its active secondary structure.

*Shunsuke Abe¹, Takaki Koayama¹, Shigeyoshi Matsumura¹, Yoshiya Ikawa¹ (1. Graduate School of Science & Engineering, University of Toyama,)

Keywords:

Lihgt-up RNA aptamer,SELEX,Chemical modification

蛍光 RNAアプタマー17-3は、GFPの発色団HBIを改変したDMHBIと結合し、その蛍光を増強することが報告されているが、構造面の知見はない。本研究では、1 ) 17-3 RNAの2次構造解析を目的とした化学修飾法、2 )蛍光能を維持した、もしくは向上した変異体の獲得を目指した進化分子工学、3 )多数の変異体の次世代シーケンス（ NGS ）による配列解析などの手法を用いて17-3 RNAの2次構造の解析を試みた。