The Annual Meeting of Japanese Society of Animal Science

【目的】遺伝的多様性の減少が危惧される兵庫県の黒毛和種（但馬牛）では，ジーンドロッピング法と主成分分析を組み合わせた手法により集団を5つの系統（G1–4，G5，G6，G7およびG8）に分類し多様性の維持を図っている．本手法は，短期的な多様性の維持に関する有効性は確認されているが，本研究では長期的な有効性の調査をコンピュータシミュレーションにより実施した．【方法】但馬牛の現存個体12,578頭をシミュレーションの基礎世代（世代0）と定義した．ここから各世代で，方法1）雄牛20頭，雌牛5,000頭を無作為に選抜，あるいは方法2）系統分類を行い，各系統で雄牛4頭，雌牛1,000頭を「系統らしさ指標（DL）」により選抜し，世代15まで集団を発生させた．DLとは，第1から第3主成分得点で個体を空間にプロットし，原点およびx・y・z平面から遠いものを優れていると評価する指標である．【結果】平均近交係数は，方法1）では世代1の0.245から世代15の0.310まで増加したが，方法2）では世代15で0.493にまで達し，系統内交配が集団の近交度を大きく増加させた．一方で両方法の遺伝的多様性指数（GDt）はほぼ同等であった．方法2）において，GDtを構成する要素のうち系統内の遺伝的多様性はGDt以上に大きく減少したが，系統間の遺伝的多様性は0.039（世代1）から0.176（世代15）まで増加した．しかし，方法2）では維持が困難になる系統が認められ，G5では98%の反復で世代5まで到達できなかった．