講演情報
[8a-C214-2]ELGP ナノポアにおける ssDNA 通過イベントの自動検出およびタグ付データセットの構築
〇(DC)小野澤 燿1、若林 広佑1、小河原 利輝1、蒲生 捷太1、郭 正澤1、矢野 実2、伊澤 誠一郎1、笹川 洋平2、二階堂 愛2、真島 豊1 (1.東京科学大フロ研、2.東京科学大難治研)
キーワード：
ナノポア、DNAシーケンサー、微細加工技術
DNA を切断せずに読み取り構造変異の解析が可能なナノポアシーケンサーが注目されてい
る。我々は ELGP 金ナノポアにより低速な約 140 nt/s の ssDNA 通過イベントを観察してき
た。塩基配列解析には通過イベントと配列情報の対応付けが重要だが、膨大な電流波形の
目視抽出は非効率である。本研究では HMM により通過イベントを自動検出し、配列・作
製・測定条件を付与したタグ付きデータセットを構築した。
る。我々は ELGP 金ナノポアにより低速な約 140 nt/s の ssDNA 通過イベントを観察してき
た。塩基配列解析には通過イベントと配列情報の対応付けが重要だが、膨大な電流波形の
目視抽出は非効率である。本研究では HMM により通過イベントを自動検出し、配列・作
製・測定条件を付与したタグ付きデータセットを構築した。