Odd (2P-001~2P-047)

[2P-029] Effect of adjacent base of target cytosine in photochemical RNA editing using reversible RNA photo-cross-linking

*Syu Kawazoe¹, Kanako Ishino¹, Shigetaka Nakamura¹, Kenzo Fujimoto¹ (1. School of Materials Science ,School of Advanced Science and Technology, Japan Advanced Institute of Science and Technology)

Keywords:

RNA editing,Photoresponsive artificial nucleic acid,Cytosine,Uracil

光により架橋と開裂が可能な光応答性人工核酸3-cyanovinylcarbazole(^cnvK)を用い、オフターゲット効果のリスクを軽減するために、細胞内に一本鎖で存在するRNAを標的とした光化学的核酸塩基編集を試み、脱アミノ化効率に対する標的シトシンの周囲環境の影響を明らかにしようと考えた。結果として標的RNA鎖中のシトシン周辺の親水性がRNA編集(C→U)に大きな影響を及ぼしていることが示唆された。