Poster Session (P169-P202)

[P171] Development of uracil specific ultrafast photo-cross-linking reactions for RNA FISH in cell

*Eita Satonaka¹, Yasuyuki Narita¹, Jun-ichi Mihara¹, Siddhant Sethi¹, Kenzo Fujimoto¹ (1. Biofunctional Medical Engineering Research Area, Japan Advanced Institute of Science and Technology)

Keywords:

single nucleotide polymorphism,optical cross-link device,FISH,3-cyanovinylcarbazole nucleoside,4-methylpyranocarbazole nucleoside

遺伝病やウイルスの変異株を識別するためには，遺伝子領域の一塩基多型を正確に見分ける必要がある。当研究室では，光架橋素子^CNVKを組み込んだ人工核酸probeを用いたFISH法において，検出難度の高いRNAの解析を成功させた。しかし，^CNVKは一塩基多型の正確な同定が困難，細胞への光毒性などの課題があった。そのため，これらの課題を改善した^MEPKの開発に挑戦した。^MEPKを有した核酸probeを用いた正確な細胞内RNA-光FISHが期待される。