講演情報

[22a-P03-10]第Xa因子阻害薬のMM-MD/FMOによる相互作用解析

〇芳根 僚平1、平野 秀典2、土居 英男1、北原 駿1、秋澤 和輝1、奥脇 弘次1,3、山本 詠士2、泰岡 顕治2、望月 祐志1,4 (1.立教大理、2.慶應大理工、3.JSOL、4.東大生研)

キーワード:

第Xa因子阻害薬,MD-FMO連携計算,相互作用解析

4つの抗凝固薬とXa因子の複合体でMD-FMO連携計算による統計的な相互作用解析を行いました。ファーマコフォアはS1とS4の2つのポケットからなり、それぞれのポケットでリガンドと相互作用しているアミノ酸残基は、リガンドごとに異なることが分かりました。また、リガンドの荷電によって相互作用の強まるアミノ酸残基が存在することと、ポケット内部への水の侵入も確認できました。