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Biomek i7による single-cell RNA-seq/T細胞受容体解析のライブラリ調整自動化の実際とT細胞のCOVID-19ワクチン応答解析への応用

次世代シーケンサー(NGS)を用いた網羅的遺伝子発現解析は、single-cell RNA-seq (scRNA-seq)を始めとして高度化・多検体化・高価格化の傾向にあり、大規模な解析の実施や幅広い解析支援を行う上で、NGSライブラリ調整の自動化は実験失敗リスクの低減やスループット向上の観点から重要である。Biomek i7は液体の分注のみならず、NGSライブラリ調整に必要な機器や環境との接続、高密度なデッキポジション数、柔軟なプログラム設計機能によりNGSライブラリ調整工程大半の自動化が可能である。当教室では独自に開発したscRNA-seqやT細胞受容体解析(TCR-seq)の自動化をbiomek i7で実装し、解析支援を産学問わず広く提供してきた。本講演では、Biomek i7によるscRNA-seq/TCR-seqライブラリ調整自動化の実装の実際とそのtips、またそれを活用したCOVID-19ワクチンに対するT細胞応答解析への応用例について紹介したい。

第48回日本分子生物学会年会

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[2BS-02-01]Biomek i7による single-cell RNA-seq/T細胞受容体解析のライブラリ調整自動化の実際とT細胞のCOVID-19ワクチン応答解析への応用

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